Создание Инновационной обсерватории, предназначенной для улучшения координации Национальной инновационной системы Республики Казахстан, предусмотрено в рамках проекта «Стимулирование продуктивных инноваций», реализуемого в рамках Соглашения о займе между Республикой Казахстан и Международным банком реконструкции и развития №8463-KZ от 9 июня 2015 года, ратифицированного Законом Республики Казахстан от 2 февраля 2016 года «О ратификации соглашения о займе (Проекта стимулирования продуктивных инноваций) между Республикой Казахстан и Международным Банком Реконструкции и Развития»
Создание Инновационной обсерватории также предусмотрено в рамках реализации
п. 114 План-графика по реализации национального проекта «Технологический рывок за счет цифровизации, науки и инноваций», утвержденного Постановлением Правительства РК от 12 октября 2021 года № 727;